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Leçon 4/12 · Les RH de la structure

Vacataires et remplaçants : qui paie quoi

Deux statuts que tout oppose, et qu'on confond tout le temps. Rétrocession contre facturation à l'unité, TVA, comptabilisation des honoraires, et la question qui fâche : un remplaçant a-t-il droit à une part de l'ACI ?

17 min de lectureVérifié le 15/08/2026

L'essentiel en 3 points

  • Un vacataire facture à l'unité (tarif horaire, forfait demi-journée, forfait mission) : c'est une dépense de la structure. Un remplaçant perçoit des honoraires et en rétrocède un pourcentage au titulaire : ce flux est personnel, il ne passe pas par la comptabilité de la structure.
  • L'honoraire d'un vacataire se comptabilise en charge « Honoraires » (622600). Ce qui remonte ensuite dans les quotes-parts est le coût net : le plus souvent rien, parce que la vacation est logée dans une enveloppe financée par la rémunération d'équipe ou par une subvention — mais une vacation non financée reste une charge commune ordinaire.
  • Pour la CPAM, un remplaçant n'existe pas : il n'est ni signataire de l'ACI ni associé de la SISA. Reconnaître sa participation suppose une clause écrite, pas un arrangement oral.

Deux modèles, à ne jamais confondre

C'est la confusion la plus coûteuse du sujet, parce qu'elle contamine tout ce qui suit : les documents à produire, les écritures comptables, et jusqu'à la fiscalité de l'intervenant.

Aller plus loinGuideIrdesNational

Accueil - IRDES

Les travaux de l'institut sur l'exercice regroupé donnent des ordres de grandeur sur le recours aux intervenants externes — à citer plutôt qu'un chiffre de seconde main si vous devez motiver un choix devant l'équipe.

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  • Rémunération

    Vacataire
    À l'unité : tarif horaire, forfait demi-journée ou forfait mission. Jamais un pourcentage.
    Remplaçant
    Il encaisse les honoraires des actes et en rétrocède un pourcentage au titulaire qu'il remplace.
  • Qui le fait entrer

    Vacataire
    La structure : c'est elle qui a besoin d'une compétence (diététicienne, psychologue, intervenant ponctuel).
    Remplaçant
    Le professionnel absent, à titre personnel : il organise son propre remplacement.
  • Flux financier

    Vacataire
    La structure lui verse un honoraire. C'est une charge de la structure.
    Remplaçant
    Flux personnel entre le remplaçant et le titulaire. La structure n'est pas partie au contrat.
  • Comptabilité de la structure

    Vacataire
    Charge « Honoraires » en 622600. Ce qui arrive aux quotes-parts est le coût NET, une fois déduit ce que finance l'enveloppe qui la porte : souvent rien, pas toujours. TVA déductible en 445660 si l'intervenant est assujetti.
    Remplaçant
    Aucune écriture. Le flux ne traverse pas les comptes de la structure.
  • Points ACI

    Vacataire
    Aucun. Une vacation ne génère pas de point.
    Remplaçant
    Aucun. Le remplaçant n'est pas membre signataire.
  • Pièce à produire en fin de collaboration

    Vacataire
    Récapitulatif annuel des interventions.
    Remplaçant
    Attestation de fin de mission, une fois le remplacement terminé.
Vacataire et remplaçant : deux logiques opposées

Un vacataire ne se rémunère jamais en pourcentage

C'est une règle de fond, pas une préférence d'outil. Rémunérer un vacataire par un pourcentage des honoraires, c'est adopter la mécanique de la rétrocession sans en avoir le cadre : ni contrat de remplacement, ni autorisation de l'Ordre le cas échéant, ni la relation personnelle titulaire-remplaçant qui la justifie.

Si vous vous surprenez à vouloir écrire « 30 % » sur une fiche de vacataire, c'est presque toujours que la situation réelle est un remplacement — et qu'il faut la traiter comme tel, avec son contrat et ses pièces.

L'honoraire du vacataire : ce qui atteint vraiment les quotes-parts

Quand la structure paie une diététicienne vacataire, elle enregistre une charge « Honoraires » au compte 622600. Jusque-là, rien d'inhabituel.

Le point à comprendre est ailleurs, et il est souvent énoncé de travers. On entend qu'un honoraire de vacataire « ne se ventile jamais » entre les associés. Ce n'est vrai que si la dépense est financée par ailleurs — et c'est justement le cas le plus fréquent : la plupart des équipes logent les vacations dans une enveloppe « projet de santé » ou « actions de prévention » couverte par la rémunération d'équipe ou par une subvention. Il ne reste alors rien à faire porter à personne.

La règle générale est celle qui vaut pour toute charge commune : ce qui se ventile est le coût net, une fois déduit ce que l'enveloppe reçoit d'un financement. Si l'équipe décide une vacation qu'aucune ressource ne couvre, son coût est une charge commune comme une autre, et il suit la règle de son enveloppe. Le statut de l'intervenant n'y change rien : c'est le financement qui décide, pas le fait que le vacataire ne soit l'associé de personne.

Autre subtilité, qui surprend souvent : l'écriture apparaît dans votre export comptable une fois le paiement rapproché en banque, pas à la simple saisie de l'intervention. Une vacation notée dans l'outil mais jamais payée n'est pas encore une écriture.

La TVA du vacataire : le piège du tarif « TTC »

Par défaut, un vacataire est non assujetti à la TVA — c'est le cas des professionnels de santé dont les honoraires de soins sont exonérés. Son tarif est alors traité tel quel : le montant hors taxes et le montant toutes taxes comprises sont identiques, il n'y a pas de TVA.

Mais certains intervenants sont assujettis : un psychologue selon son activité, un formateur, un consultant. Dans ce cas, le taux (20 % par défaut) s'ajoute par-dessus le tarif hors taxes. La TVA se comptabilise en TVA déductible (445660), à côté de l'honoraire en 622600.

D'où le piège : si vous négociez « 90 € la demi-journée » avec un intervenant assujetti en pensant « tout compris », vous paierez en réalité 108 €. Demandez toujours si le tarif annoncé est hors taxes ou toutes taxes comprises, et notez la réponse.

Aller plus loinGuideAutorité des normes comptablesNational

Plan comptable général

Le règlement ANC 2014-03 consolidé et le plan de comptes en vigueur : la source des numéros 622600 (honoraires) et 445660 (TVA déductible) cités dans cette leçon.

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Un troisième statut, souvent oublié : le prestataire

Ni vacataire ni remplaçant : le prestataire est une entreprise — une société de ménage, un cabinet de conseil, un prestataire informatique — qui facture une mission avec son propre numéro SIRET, sans lien de subordination avec la structure.

La distinction compte, parce que la confondre avec un vacataire expose à un risque réel : si la structure fixe les horaires, impose des méthodes de travail et exerce un contrôle constant sur un « prestataire » qui n'a en réalité que ce nom, la relation peut être requalifiée en contrat de travail — avec rappel de charges sociales à la clé. Un vrai prestataire garde son autonomie d'organisation ; c'est ce qui le distingue, plus que le montant facturé ou la régularité de l'intervention.

Salarié, vacataire, remplaçant, prestataire : quatre statuts, quatre logiques

Salarié

Lien de subordination avec la structure. Contrat de travail, bulletin de paie, cotisations patronales.

Vacataire

Facturation à l'unité par la structure. Charge « Honoraires » (622600), aucun lien de subordination organisé.

Remplaçant

Rétrocession d'honoraires au titulaire remplacé. Flux personnel, hors comptabilité de la structure.

Prestataire

Entreprise avec son propre SIRET, facture une mission en gardant son autonomie. Risque de requalification si la structure impose horaires et méthodes.

Le critère qui sépare vraiment ces statuts n'est pas le montant facturé : c'est la présence ou l'absence d'un lien de subordination organisé par la structure (code du travail, régime du contrat de travail).

Exemple fictif — Deux demi-journées aux Trois Rivières

« Les Trois Rivières » est une équipe fictive : elle sert de fil rouge chiffré à ces leçons.

Mme Diallo, diététicienne vacataire, intervient au tarif de 90 € la demi-journée. En mars, elle assure deux ateliers d'éducation à l'alimentation.

Si elle n'est pas assujettie à la TVA (cas le plus fréquent pour ce type d'intervention) :

  • 2 × 90 € = 180 €, sans TVA. La structure enregistre 180 € en charge 622600.

Si elle est assujettie au taux de 20 % :

  • Hors taxes : 180 €
  • TVA : 36 €
  • Toutes taxes comprises : 216 €
  • La structure enregistre 180 € en 622600 et 36 € en TVA déductible (445660).

Dans les deux cas, ces 180 € de charge ne sont pas répartis entre les 12 associés au prorata de leurs parts : c'est la structure qui les supporte, sur son budget d'actions de prévention.

Et dans les deux cas, aucun point ACI n'est généré par ces vacations : la rémunération d'un intervenant externe n'est pas une activité de membre.

La question qui fâche : le remplaçant et l'ACI

Un associé part quatre mois en congé maternité. Sa remplaçante s'installe, utilise le logiciel métier, soigne les patients. Et, parce qu'elle est consciencieuse, elle participe aux réunions de concertation, applique les protocoles, s'investit dans la dynamique de l'équipe.

A-t-elle droit à une part de l'ACI ?

La position de l'Assurance Maladie est nette : non. La remplaçante n'est ni signataire de l'accord, ni associée inscrite au greffe. Elle n'existe pas dans ce cadre. L'ACI est versé à la structure, qui rémunère ses membres — donc, ici, l'associée remplacée.

Et pourtant, sur le terrain, c'est la remplaçante qui a fait le travail de coordination pendant quatre mois. Ne rien prévoir revient à laisser une injustice s'installer, et à décourager exactement le comportement qu'on voudrait encourager.

Aller plus loinGuideAssurance MaladieNational

La rémunération forfaitaire des maisons de santé pluriprofessionnelles (MSP)

La page qui définit qui sont les « membres » rémunérés par l'ACI : elle ne mentionne à aucun moment les remplaçants, ce qui confirme la lecture retenue par l'Assurance Maladie.

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  • Ajuster le taux de rétrocession

    Comment ça marche
    Le titulaire baisse le pourcentage qu'il retient (par exemple de 30 % à 20 %) pour compenser globalement l'implication du remplaçant.
    Ce qu'elle vaut
    Simple à mettre en œuvre, et purement contractuel entre les deux professionnels. Mais c'est une compensation à l'aveugle : le montant ne correspond à aucune mesure de ce qui a été réellement fait.
  • Écrire une clause au règlement intérieur

    Comment ça marche
    Le règlement intérieur prévoit qu'au-delà d'une durée donnée, la part variable générée par la présence effective du remplaçant est isolée. La structure la verse au titulaire, qui s'engage par son contrat de remplacement à la reverser.
    Ce qu'elle vaut
    Traçable, explicable à toute l'équipe et applicable de la même façon à tous les remplacements. C'est la méthode à privilégier — et elle se prépare avant le premier remplacement, pas pendant.
Deux façons de reconnaître la participation d'un remplaçant

Pourquoi le règlement intérieur, et pas les statuts

Parce qu'il se modifie vite et sans frais. Modifier des statuts suppose une assemblée, une modification déposée, des délais et des coûts. Modifier un règlement intérieur suppose une décision d'équipe et une signature.

Or ces règles de répartition sont exactement celles qu'on ajuste après les avoir essayées une fois. Les graver dans les statuts, c'est se condamner à ne jamais les corriger.

Les pièces obligatoires, et le fail-closed

Un intervenant externe n'entre pas dans une structure de soins sur une poignée de main. Selon le cas, le dossier comprend le contrat, l'attestation de responsabilité civile professionnelle, le règlement intérieur signé — et, pour un médecin remplaçant, l'autorisation du Conseil de l'Ordre.

Cette dernière pièce n'est pas administrative : sans elle, le remplacement n'a pas d'existence régulière. Le bon réflexe est donc le refus par défaut — tant que la pièce n'est pas là, le remplacement ne démarre pas. C'est plus confortable à appliquer avant qu'après.

Un point d'organisation qui fait gagner beaucoup de temps : chaque externe dispose de son propre espace personnel, où il dépose ses pièces, renseigne ses coordonnées bancaires et signe. Vous ne saisissez rien à sa place, et il n'accède à rien d'autre que son dossier.

Aller plus loinGuideConseil national de l'Ordre des médecinsNational

Le remplacement d'un médecin

La procédure d'autorisation vue du Conseil départemental : documents à joindre, cas d'un étudiant remplaçant, information de l'ARS. La pièce que ce paragraphe vous demande de vérifier avant tout démarrage.

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Aller plus loinGuideAVECsantéNational

Pratiques et métiers en équipe de soins primaires

Le référentiel du réseau national sur les pratiques en équipe de soins primaires : utile pour situer où un remplaçant, lui aussi, peut s'insérer dans les protocoles et la dynamique collective.

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Guide SisaFlow — pas à pas dans l'application

Gérer vos intervenants externes dans SisaFlow

Conformité, planning, facturation, séries de vacations récurrentes et portails personnels : la mise en œuvre écran de cette leçon.

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Selon votre rôle

  • Gérant de SISA

    Trois points vous concernent directement : l'honoraire d'un vacataire est une charge de la structure, et ce qui atteint les quotes-parts est le coût NET, une fois déduit ce que finance l'enveloppe qui le porte — la question est celle du financement, jamais celle du statut de l'intervenant ; la rétrocession d'un remplaçant ne passe pas du tout dans votre comptabilité ; et la question de l'ACI du remplaçant se règle dans le règlement intérieur, pas au cas par cas.

  • Coordinateur·rice

    Vous êtes souvent celui qui accueille ces intervenants et qui découvre, en cours de mission, que les pièces manquent. Retenez la logique des deux portails scellés : chaque externe gère son propre dossier, vous ne saisissez rien à sa place — et un remplaçant médecin ne peut pas démarrer sans l'autorisation de l'Ordre.

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